Первой женой режиссёра стала актриса Анастасия Вертинская. Союз просуществовал всего пять лет, у пары родился сын Степан. Он решил продолжить режиссёрскую династию.
От союза с Аллой Сиваковой в 1992 году у Степана появилась дочка Александра. Уже в 15 лет способная девушка окончила школу экстерном. Затем она поступила на исторический факультет МГУ. Саша Михалкова не захотела построить карьеру модели или актрисы, хотя по родственной линии ей передались изящные черты лица.
29-летняя художница замужем за Петром Скворцовым и воспитывает с ним детей. Александра пишет картины, которые ценятся любителями изобразительного искусства.
Второй женой режиссёра стала Татьяна Михалкова, в браке с которой у него родилось трое детей. В следующем году пара отпразднует золотую свадьбу. Саша — не единственная внучка Никиты Сергеевича, всего у него 11 внуков.